明末三大奇案是指发生在明朝万历末年的、彼此相关的三个宫廷案件，即“梃击”、“红丸”、“移宫”三案。这三起事件本身并不是很重要，但是其背后牵扯的势力错综复杂，各方心怀鬼胎，这标志着明末纷乱和衰亡的开始。
1.梃击案万历四十三年(公元1615年)五月初四晚间，有个手持枣木棒(在皇宫行刺也不带个像样的武器，真怀疑指使者的动机)的汉子，悄悄闯进了皇太子居住的慈庆宫，并用木棍将守卫宫门的人打伤，又闯入前殿的屋檐下，被擒获。这就是所谓梃击案。谋杀者张差据说是名疯子，受人指使，欲加害皇太子。在审理过程中，案情几次反复。实际情形是，谋杀者张差不疯不傻，是受宫内太监的引诱，并被接应到宫内行凶。由于皇家内部的矛盾和朝官的派系之争，受牵连的人很多，甚至有说是戚继光部队的逃兵，在当时造成了很大的影响。
2.红丸案公元1620年八、九月之交，刚当皇帝不过30天的朱常洛一命呜呼了。据说他的死，与他病中所服的红色药丸(鸿胪寺丞李可灼所献)有关。红色药丸究竟是寿药、道家丹丸还是别的什么毒药？一时间朝野纷沸，连宰相、皇贵妃都被牵连到此案之中。这就是“红丸”案。
东林于是开展攻击，称郑家有意谋害皇帝。继泰昌帝而后新登极的天启皇帝朱由校迫于舆论压力，准许内阁首辅方从哲退休，将崔文升发配南京，李可灼充军，此案草草收场。“红丸案”成为明宫疑案之一。转年，东林孙慎行等复官，又曾发此案以攻击方从哲。次辅韩广等出面调解。最后调查结果称在场“众臣皆有罪”。直到天启五年(1625年)，魏忠贤上《三朝要典》，遂免可灼遣戍。李可灼这个案子，一直争吵了八年，成为天启朝党争的题目之一。
移宫案，为明末三大案之一。明万历四十八年(1620年)七月，明光宗朱常洛即位，为泰昌元年，宠妃李选侍照顾皇长子朱由校迁入干清宫。不到一个月后，光宗死于红丸案，立熹宗为帝。李选侍又想继续侍奉熹宗。当时，郑贵妃、李选侍、魏忠贤来往甚密。魏忠贤想利用熹宗年幼之机，把持朝政大权，坚持让李选侍居住在熹宗所在的干清宫内;都给事中杨涟、御史左光斗等，为防其干预朝事，逼迫李选侍移到仁寿殿哕鸾宫。此事件史称“移宫案”。此案议论颇多，后来成为派系斗争的代名词。
魏忠贤此时尚未形成自己的阉党派系，被杨涟等东林党人压制，所以日后才加倍报复，这是后话。
这三大案集中在明朝末期，且都与泰昌皇帝朱常洛有关。朱常洛是明代传奇色彩最浓的一位皇帝，明宫三大疑案都与他有关，皇位也仅坐了一个月就驾崩了，死后陵寝也是采用当年景泰帝的废陵，命运对帝王竟也如此捉弄。
